污水的厌氧处理对有机物的降解不彻底是因为厌氧条件下缺氧，对于污水中的有机物质的降解只能进行到一定程度。在厌氧条件下，微生物不能将有机物的全部碳原子氧化分解，而仅能将一部分碳原子氧化分解，并通过产生甲烷等有机物作为代谢产物。
好氧处理一般只能处理中低浓度的有机废水，而厌氧处理能处理高中低浓度的各类废水，而且有些有机物对好氧处理来说是难降解的，而对于厌氧处理来说却是可降解的。 能源需求少且能产生大量能源。
如果有机物浓度太高，就先上厌氧，因为厌氧的负荷比较高，同时可以把一些大分子物质转化为小分子，对接下来的好氧阶段有好处，由于厌氧的去除率不是很高，出水不能直接排放，一般不单独使用。好氧生物处理是在有游离氧（分子氧）存在的条件下，好氧微生物降解有机物，使其稳定、无害化的处理方法。
有些有机物对好氧生物处理法来说是难降解的，但对厌氧生物处理是可降解的、如固体有机物、着色剂蒽酿和某些偶氮染料等。（2）能耗低 好氧法需要消耗大量能量供氧，曝气费用随着有机物浓度的增加而增大，而厌氧法不需要允氧，而且产生的沼气可作为能源。废水有机物达一定浓度后，沼气能量可以抵偿消耗能量。
好氧池是污水处理厂中一种生物反应池，主要用于在有氧条件下处理污水。在此池中，微生物通过有氧代谢分解污水中的有机物，使其转化为无害的稳定物质。好氧池中的微生物包括细菌、藻类等，它们共同协作，有效去除污水中的有机污染物。
厌氧池是营造厌氧的环境（溶解氧约为零），指没有溶解氧，也没有硝酸盐的反应池。其作用是活性污泥吸附，降解有机物。缺氧、厌氧、好氧池的互相作用是互为串联、互相影响。
污水处理过程中的好氧池、厌氧池和缺氧池是三种关键的处理构筑物，它们各自扮演着不同的角色。好氧池是通过持续的曝气技术，保持水中溶解氧水平在大约4毫克/升，这种环境有利于好氧微生物的生长和繁殖。这些微生物能够有效地分解和去除水中的污染物质，是污水处理的第一步。
好氧池的作用是让活性污泥进行有氧呼吸，进一步把有机物分解成无机物。去除污染物的功能。运行好是要控制好含氧量及微生物的其他各需条件的好。这样才能使微生物具有最大效益的进行有氧呼吸。厌氧处理是利用厌氧菌的作用，去除废水中的有机物，通常需要时间较长。
污水处理厌氧菌主要包括以下几种： 厌氧杆菌 厌氧杆菌是污水处理中的常见厌氧微生物之一。它们可以在无氧环境下进行发酵反应，分解有机物质并产生沼气等产物。这些细菌在污水处理中起到了重要的角色，能够降解多种有机物，减轻后续处理负荷。
兼性厌氧菌（facultativeanaerobe）又称兼嫌气性微生物，兼嫌气菌。在有氧或无氧环境中均能生长繁殖的微生物。在有氧（O2）或缺氧条件下，可通过不同的氧化方式获得能量。如酵母菌在有氧环境中进行有氧呼吸，在缺氧条件下发酵葡萄糖生成酒精。许多肠道细菌，如大肠杆菌等均属此类。
硝化细菌：硝化细菌 （ Nitrifying bacteria ） 是一种好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。广泛存在大自然各个角落，空气、江河、大海、土壤都有，生物学中发现的硝化细菌有几千种之多。
好氧池用甘度硝化细菌：主要降解氨氮 氨氮的去除所用的细菌是硝化细菌，硝化细菌属于好氧菌种，主要应用于好氧池，其成分主要是亚硝酸菌和硝酸菌组成。
厌氧池是营造厌氧的环境（溶解氧约为零），指没有溶解氧，也没有硝酸盐的反应池。其作用是活性污泥吸附，降解有机物。缺氧、厌氧、好氧池的互相作用是互为串联、互相影响。
污水处理中的厌氧和好氧的意思是：厌氧就是不喜欢氧气，微生物的工作环境不能有氧气，相反，好氧菌的工作环境则必须含有氧气。在污水处理过程中，废水厌氧生物处理在早期又被称为厌氧消化、厌氧发酵，是指在厌氧条件下由多种（厌氧或兼性）微生物的共同作用下，使有机物分解并产生CH4和CO2的过程。
污水处理厂中的好氧池、厌氧池、缺氧池含义如下：好氧池：好氧池是污水处理厂中一种生物反应池，主要用于在有氧条件下处理污水。在此池中，微生物通过有氧代谢分解污水中的有机物，使其转化为无害的稳定物质。好氧池中的微生物包括细菌、藻类等，它们共同协作，有效去除污水中的有机污染物。
厌氧就是不喜欢氧气，微生物的工作环境不能有氧气，相反，好氧菌的工作环境则必须含有氧气，兼性菌则对氧的要求不高，有氧可以活动，没有氧也能工作。因为各种微生物的适应性和分解不同化学物质的能力不同，在进行污水处理时往往根据水质选择菌种。
缺氧池是营造缺氧环境（溶解氧在小于0.5mg/L），指没有溶解氧但有硝酸盐的反应池。利于缺氧微生物生长。其作用是活性污泥吸附，降解有机物。厌氧池是营造厌氧的环境（溶解氧约为零），指没有溶解氧，也没有硝酸盐的反应池。其作用是活性污泥吸附，降解有机物。
缺氧池是一种介于厌氧和好氧条件下的生物反应池。它通常位于好氧处理之前或之后，作为过渡阶段。在缺氧池中，尽管存在溶解氧，但水平较低，不足以支持完全的好氧过程。缺氧池的主要作用是进行反硝化过程，即通过反硝化细菌将硝酸盐中的氮还原为氮气，从而去除污水中的氮。
污水处理过程中的好氧池、厌氧池和缺氧池是三种关键的处理构筑物，它们各自扮演着不同的角色。好氧池是通过持续的曝气技术，保持水中溶解氧水平在大约4毫克/升，这种环境有利于好氧微生物的生长和繁殖。这些微生物能够有效地分解和去除水中的污染物质，是污水处理的第一步。